一根漂亮的擴增曲線絕對是他們的心情曲線,
如果突然這根擴增曲線翹尾了,
心情大概就是

小朗最近就收到這樣一名用戶的反饋,
她說在進行PCR實驗時,
擴增曲線翹尾了......
她的擴增曲線如下圖所示:
那么下面的內(nèi)容絕對值得你收藏!
擴增曲線翹尾是指在實驗結(jié)果中有曲線出現(xiàn)末尾起跳但是沒有完整擴增的現(xiàn)象,導致這個現(xiàn)象出現(xiàn)的原因深究下來主要是2點:
1、目的基因濃度過低,CT值過高,導致曲線后移,這樣就會出現(xiàn)翹尾現(xiàn)象;
2、在反應(yīng)體系中沒有加入模板DNA的情況下,外源污染的核酸進入反應(yīng)體系也會出現(xiàn)翹尾。
彌散到實驗室各個角落,比較棘手;
移液器、離心機、核酸提取儀、傳遞窗、PCR儀、拆開的試劑盒、槍頭盒、打開的耗材等表面。
以小編的實踐經(jīng)驗發(fā)現(xiàn)不同來源的核酸污染帶來的風險指數(shù)不同(下圖數(shù)據(jù)僅供參考)。

嚴格的PCR實驗室應(yīng)有標準的正負壓系統(tǒng)及四分區(qū)(或三分區(qū)),
實驗室應(yīng)按照生物安全二級實驗室及PCR實驗室設(shè)計基本要求來建設(shè)。
可參考的標準為《GB50346-2011建設(shè)標準生物安全實驗室建筑技術(shù)規(guī)范》
及衛(wèi)健委下發(fā)的《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴增檢驗實驗室工作導則》。
PCR實驗室若不規(guī)范進行分區(qū),容易發(fā)生氣溶膠污染。
現(xiàn)有技術(shù)指導原則,要求選擇BSL-Ⅱ級生物安全柜。
從臨床經(jīng)驗來看,只有B2型生物安全柜為全排放,
無循環(huán)風,可以用于加核酸模板。不建議A1型、A2型和B1型,
因其循環(huán)風很容易造成核酸氣溶膠的形成,且污染很難清除。
吸取陽性對照(質(zhì)粒)沒有遵循“慢吸快打”的原則(這個需要練習形成“肌肉記憶”)。
新手往往是“快吸快打”,容易造成陽性樣品污染槍頭,
或者在生物安全柜循環(huán)風的影響下,造成氣溶膠飛濺,污染加樣區(qū)域。
應(yīng)使用帶有濾芯的槍頭。
且加完樣的槍頭要丟入含有次氯酸溶液的加蓋垃圾桶中
(因為次氯酸容易揮發(fā),因此應(yīng)每天都要更換含氯消毒液?。?/p>
《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴增檢驗實驗室工作導則》指出,
短片段的基因核酸對紫外線損傷不敏感。
常規(guī)消毒劑如酒精、碘化物、戊二醛類、季銨鹽等雖然能殺菌,
但是不能降解核酸,或降解效率較差。
次氯酸鹽類消毒劑可以一定程度降解核酸,
但是腐蝕性強,不能處理精密儀器及金屬制品,
容易腐蝕移液器吸桿影響tip頭氣密性。
紫外線照射12~18小時,但是注意,紫外線有效距離在80cm~100cm之間,
且對200bp以下的短片段核酸不敏感,容易留死角,所以還要同時加強通風。
吸附在儀器設(shè)備等物體表面上的核酸污染處理:使用沒有腐蝕性的核酸清除劑。
例如使用酶解法(耐熱核酸降解酶)的清除劑,
處理移液器、生物安全柜、離心機、傳遞窗等區(qū)域進行噴灑清除。
靜置15分鐘即可。
丟棄3個分區(qū)的所有用過的耗材(主要是tip吸頭和離心管、拆開的試劑盒等)、
非一次性實驗服工作服應(yīng)用次氯酸鹽溶液浸泡1小時后,進行洗滌處理;
盡量使用一次性生物安全Ⅱ級防護服或?qū)嶒灧?/p>

標本進行核酸提取和檢測時應(yīng)盡可能在生物安全柜內(nèi)進行操作。
如為打開標本管蓋或其他有可能產(chǎn)生氣溶膠的操作,則必須在生物安全柜內(nèi)進行。
每天實驗后,使用0.2%含氯消毒劑或75%酒精進行臺面、地面清潔。
除了上面常規(guī)的消毒清潔之外,另外可采用專門的實驗室污染去除儀去除實驗室核酸污染。
樣品臺清潔:
用加液槍加取125ul 75%乙醇溶液或異丙醇至所有孔內(nèi)。使用加液槍對孔內(nèi)溶液進行多次吹洗,移除孔內(nèi)的液體。
再用加液槍加取125ul核酸清除劑至所有孔內(nèi)。使用加液槍對孔內(nèi)溶液進行多次吹洗,移除孔內(nèi)的液體。
使用純凈水進行二次吹洗,移除孔內(nèi)的液體,設(shè)置運行程序 93℃、5分鐘,熱蓋關(guān)閉,使96孔模塊內(nèi)水漬蒸干。
注:若遇見樣品臺孔內(nèi)異物頑固或較多情況,可先用酒精棉拿鑷子清理;再使用加液槍清洗。
儀器表面清潔:
應(yīng)使用0.2%含氯消毒劑或75%酒精進行清潔。

污染,是PCR實驗室出現(xiàn)假陽性、結(jié)果不可信、數(shù)據(jù)不可靠的重要推手。
而且因?qū)嶒炇椅廴竞箅y以清除,導致實驗室廢棄也是屢見不鮮的。
所以,在最初建立PCR實驗室的時候,
應(yīng)考慮最大程度地降低可能出現(xiàn)的PCR污染或杜絕污染的出現(xiàn),
在實驗室前期設(shè)計及日常實驗室管理和操作中,
就需要進行合理的規(guī)劃以及嚴格執(zhí)行實驗室SOP,把污染的可能性扼殺在搖籃中。